MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 40714

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_015574	CTG	2	6	129256	129261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986347
2002	NC_015574	CTG	4	12	129289	129300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986347
2003	NC_015574	TGC	2	6	129305	129310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986347
2004	NC_015574	TGA	2	6	129317	129322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986347
2005	NC_015574	TGTC	2	8	129349	129356	0 %	50 %	25 %	25 %	333986347
2006	NC_015574	T	6	6	129398	129403	0 %	100 %	0 %	0 %	333986347
2007	NC_015574	GTTG	2	8	129416	129423	0 %	50 %	50 %	0 %	333986347
2008	NC_015574	CAA	2	6	129457	129462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986347
2009	NC_015574	CAA	2	6	129493	129498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986347
2010	NC_015574	GAT	2	6	129509	129514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986347
2011	NC_015574	CCAT	2	8	129664	129671	25 %	25 %	0 %	50 %	333986347
2012	NC_015574	CTC	3	9	129685	129693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986347
2013	NC_015574	TCT	2	6	129822	129827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986347
2014	NC_015574	GTTT	2	8	129850	129857	0 %	75 %	25 %	0 %	333986347
2015	NC_015574	CTT	2	6	129927	129932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986347
2016	NC_015574	TCC	2	6	129947	129952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986347
2017	NC_015574	TTG	2	6	130051	130056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986347
2018	NC_015574	GTT	2	6	130115	130120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986347
2019	NC_015574	TTC	2	6	130163	130168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986347
2020	NC_015574	TTA	2	6	130210	130215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986347
2021	NC_015574	T	6	6	130221	130226	0 %	100 %	0 %	0 %	333986347
2022	NC_015574	TCAT	2	8	130644	130651	25 %	50 %	0 %	25 %	333986348
2023	NC_015574	TTTG	2	8	130683	130690	0 %	75 %	25 %	0 %	333986348
2024	NC_015574	CAA	2	6	130705	130710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986348
2025	NC_015574	GAT	2	6	130725	130730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986348
2026	NC_015574	TGC	2	6	130873	130878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986348
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2029	NC_015574	CTT	2	6	131011	131016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986348
2030	NC_015574	CTT	2	6	131023	131028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986348
2031	NC_015574	T	6	6	131162	131167	0 %	100 %	0 %	0 %	333986348
2032	NC_015574	GGT	2	6	131169	131174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986348
2033	NC_015574	GCT	3	9	131193	131201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986348
2034	NC_015574	GAA	2	6	131232	131237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986348
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2036	NC_015574	GAT	2	6	131370	131375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986348
2037	NC_015574	CAA	2	6	131395	131400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986348
2038	NC_015574	TGC	3	9	131411	131419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986348
2039	NC_015574	A	6	6	131426	131431	100 %	0 %	0 %	0 %	333986348
2040	NC_015574	TGA	2	6	131456	131461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986348
2041	NC_015574	TAT	2	6	131489	131494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986348
2042	NC_015574	TG	3	6	131507	131512	0 %	50 %	50 %	0 %	333986348
2043	NC_015574	TCAA	2	8	131542	131549	50 %	25 %	0 %	25 %	333986348
2044	NC_015574	TAT	2	6	131761	131766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986349
2045	NC_015574	TAAAA	2	10	131782	131791	80 %	20 %	0 %	0 %	333986349
2046	NC_015574	A	6	6	131795	131800	100 %	0 %	0 %	0 %	333986349
2047	NC_015574	AAC	2	6	131833	131838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986349
2048	NC_015574	CTG	2	6	131891	131896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986349
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2050	NC_015574	TGT	2	6	131991	131996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986349
2051	NC_015574	GAA	2	6	132023	132028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986349
2052	NC_015574	GGTT	2	8	132086	132093	0 %	50 %	50 %	0 %	333986349
2053	NC_015574	ACAAGG	2	12	132098	132109	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	333986349
2054	NC_015574	GTC	2	6	132163	132168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986349
2055	NC_015574	CCA	2	6	132183	132188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986349
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2057	NC_015574	TCTG	2	8	132224	132231	0 %	50 %	25 %	25 %	333986349
2058	NC_015574	TGG	2	6	132237	132242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986349
2059	NC_015574	CTG	2	6	132282	132287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986349
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2061	NC_015574	T	6	6	132313	132318	0 %	100 %	0 %	0 %	333986349
2062	NC_015574	GGC	2	6	132330	132335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333986349
2063	NC_015574	TGT	2	6	132400	132405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986349
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2092	NC_015574	TGC	2	6	134910	134915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986352
2093	NC_015574	TCA	2	6	134941	134946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986352
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2095	NC_015574	ATT	2	6	134979	134984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986352
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2103	NC_015574	CGGAT	2	10	135574	135583	20 %	20 %	40 %	20 %	333986353
2104	NC_015574	CCA	2	6	135595	135600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986353
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2106	NC_015574	ATA	2	6	135792	135797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986353
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2109	NC_015574	CTT	2	6	135970	135975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986354
2110	NC_015574	TGG	2	6	136043	136048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986354
2111	NC_015574	T	6	6	136223	136228	0 %	100 %	0 %	0 %	333986354
2112	NC_015574	TCCG	2	8	136465	136472	0 %	25 %	25 %	50 %	333986354
2113	NC_015574	CTT	2	6	136480	136485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986354
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2119	NC_015574	CCA	2	6	136651	136656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986354
2120	NC_015574	TGT	2	6	136666	136671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986354
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2122	NC_015574	ACC	2	6	136814	136819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986354
2123	NC_015574	ATT	2	6	136827	136832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986354
2124	NC_015574	T	7	7	136831	136837	0 %	100 %	0 %	0 %	333986354
2125	NC_015574	CGT	2	6	136864	136869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986354
2126	NC_015574	T	6	6	136883	136888	0 %	100 %	0 %	0 %	333986354
2127	NC_015574	ACTAT	2	10	136908	136917	40 %	40 %	0 %	20 %	333986354
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2234	NC_015574	TC	3	6	143741	143746	0 %	50 %	0 %	50 %	333986359
2235	NC_015574	AGGT	2	8	143759	143766	25 %	25 %	50 %	0 %	333986359
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2241	NC_015574	TCG	2	6	144216	144221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986360
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2490	NC_015574	TAT	2	6	158383	158388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986375
2491	NC_015574	CTG	2	6	158391	158396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986375
2492	NC_015574	AAAT	2	8	158432	158439	75 %	25 %	0 %	0 %	333986375
2493	NC_015574	AGGT	2	8	158465	158472	25 %	25 %	50 %	0 %	333986375
2494	NC_015574	TCC	2	6	158473	158478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986375
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